一体化超纯水设备反渗透膜系统运行过程中要严格监控进水水质，保障进水的预处理措施稳定及运行可靠。当通水量下降或是产水水质不合格时，要及时对反渗透膜元件进行清洗再生或是更换。一体化超纯水设备反渗透膜的使用注意事项可以从如下几个方面进行： ①硬度的影响     钙镁离子的盐类，如碳酸钙、硫酸钙，在水中只有很小的溶解度，在反渗透膜的正常工作中，由于工作水在膜中被浓缩，各种盐类也会被浓缩，当到达盐类的饱和浓度时，就会在系统中产生水垢，使膜的水通量下降，脱盐率降低，膜系统的压差增加，严重影响膜的使用。
②胶体物质的影响     水中的胶体物质主要有黏土、胶体硅、金属的氧化物(氧化铁、氧化铝)等，会在膜的工作层形成胶体污堵或水垢，同样会严重影响元件的性能，造成产水量下降、脱盐率降低、膜系统的压差增加。 ③有机物的影响     水中的有机物在膜表面上的吸附会形成有机物垢，引起水通量的降低。而有机物在前处理中不容易被清除，因此选择反渗透的水源时应给予重视。
④ pH值的影响     各种反渗透膜都有自己使用的pH值的范围。超出其范围可能会造成膜的降解等破环性的问题、因此使用中应密切注意进水pH值和设备使用的pH值的范围。 ⑤水温的影响     反渗透膜对温度的变化反映非常明显，水温越高，水通量约大，但脱盐率会降低，水温越低，水通量越低，因此使用中会遇到水温与水量的变化，这是正常的变化。 ⑥进水盐浓度的影响

    进水盐浓度越高，其渗透压也越大，工作时保证水通量需要提供的压力也越高，当渗透压与高压泵的出水压力相等时，系统就不再产水，同时进水中的盐浓度越高、产水的含盐量就越高。